Deset godina nakon Ceremonijalne Borbe, tinejdžer pod imenom Judai Yuuki odlazi da se upiše i pridruži Školi Dvoboja Yousei, koja se nalazi na izolovanom Japanskom ostrvu. Na istom upoznaje učenike, te stiče nekolicinu prijatelja, ali i neprijatelja. Judai je smešten u najslabije rangirani razred, "Nebeski Crveni". Međutim, uprkos toj činjenici, odlučuje da na "dvoboj" izazove druge učenike kako bi dokazao da je dostojan kao dvoboj majstor akademije Yousei, želeći da ga pri tome svi izuzetno poštuju.