Nekada davno postojao je vampir po imenu Vanitas, omrznut od strane sopstvene vrste jer je rođen pod punim plavim mesecom, dok se većina njih uzdiže tokom crvenog. Sam i uplašen, napravio je "Knjigu Vanitasa", ukleti grimoar kojim će se jednog dana osvetiti svim vampirima; ili bar tako priča kaže. "Vanitas no Karte" prati priču Noéa, mladića 19. veka koji putuje dirižablom u Pariz s jednim ciljem: pronaći Knjigu Vanitasa. Iznenadni napad vampira dovodi ga do susreta sa zagonetnim Vanitasom, lekarom specijalizovanim za vampire, i na Noévo iznenađenje, sasvim običnim čovekom. Misteriozni lekar nasledio je i ime i ozloglašeni spis iz legende o Vanitasu, i koristi taj grimoar da leči svoje pacijente. Ali iza njegove bezazlene pojave krije se nešto malo zlokobnije...