Pri predstavljanju na prvom času u srednjoj školi, devojka po imenu Suzumija Haruhi objavljuje da želi da se druži samo sa vanzemaljcima, putnicima kroz vreme i esperima. U tu svrhu i zarad otkrivanja misterija sveta ona formira SOS Brigadu u koju uvlači nevoljnog pragmatičara i cinika Kjona. Osim njega, brigadi se pridružuju vanzemaljac, putnica kroz vreme i esper koji kriju svoje identitete i poslati su da posmatraju Haruhi. Čini se da Haruhi ima moć da menja svet i ostvaruje svoje želje, ali toga još nije svesna.