Okabe Rintaro, mladić koji je sam sebe proglasio "ludim naučnikom", odlazi na konferenciju uvaženog profesora Nakabaćija, na kojoj ga omalovažava zbog, kako tvrdi, plagiranog rada o vremeplovu od Džona Tajtora. Nakon konferencije pronalazi beživotno telo devojke Makise Kris. U šoku, šalje mejl svom prijatelju Daruu, ne znajući da mu je telefon povezan na čudnu napravnu koja podseća na mikrotalasnu pećnicu - za koju se igrom slučaja isporavlja da je upravo vremeplov. Nakon toga pronalazi Kris živu i zdravu, a Daru ga osuđuje da živi u svetu fantazija. Dok upoznaje nove ljude, Okarin eksperimentiše sa vremeplovom, što će se ispostaviti kao kobna greška koju mora da ispravi po svaku cenu, zarad onih koji su mu dragi.