Ponoćna služba za okultno prati Aratu Miyakoa, novog člana tajnog odeljenja gradske uprave Shinjukua, koje rešava slučajeve vezane za natprirodna bića nevidljiva običnim ljudima. Na prvoj misiji otkriva da može da razume njihov jezik i da ga Tengu stvorenje naziva Abe no Seimeijem, legendarnim jin-jang majstorom. Dok pokušava da shvati poreklo svog dara, Arata se suočava s opasnostima koje prate svet okultnog.